小蜜蜂“玛雅”充满了对外面世界的好奇，决定和好朋友“威利”飞出蜂巢，一探究竟。 在路上，结识了新朋友小黄蜂，可是“玛雅”怎知蜜蜂与黄蜂，为了争夺花粉，素来是天敌。 面对蜜蜂家园里，篡夺蜂后王位、嫁祸黄蜂军团的阴谋，面对一触即发的族群大战，在这险象环生的大草地里，正义善良的小蜜蜂“玛雅”，能否解开谜团，勇敢前行？
隐藏在每天交替时刻的狭缝中的时间，“影时间”。每当影时间来临，世界便停止运转，人们化为静立的棺木。之后，异形的怪物“Shadow”便现身破坏。能够与之对抗的，只有能够使用“Persona”这种特殊能力的人类。转学到私立月光馆学园的少年结城理觉醒了Persona的力量，之后被前辈桐条美鹤邀请加入“特別课外活动部”。在那里聚集的，都是同样拥有力量的Persona使用者。他们为了各自的目的追寻着影时间的真相，并与难以想像的命运展开了对峙ーー。剧场版第二章“Midsummer Knight's Dream”登场。
