《完美生物》设想了一个人类和吸血鬼和平共存的世界，当一场流行性传染病开始席卷人类后，一名吸血鬼转而袭击人类，这种微妙的平衡看似要被打破，教会派Silus去抓捕这名吸血鬼里的叛徒Edgar。Silus同一名人类警官 (Burrows)一起将要找到躲藏在黑暗地下的Edgar。
2002年10月19日，专事袭击犯罪交易现场获取高额赃款的宫本（金城武 饰），在一次行动中发现参与交易的一方居然是自己的仇敌沟口（岸谷五郎 饰），宫本的故人昔日被沟口所杀，正欲复仇的宫本却被一个突然出现的少女美里（铃木杏 饰）打乱了步骤，只得听任沟口逃离。美里自称是来自2084年的未来人。未来的世界遭到外星人袭击，躲避在西藏的幸存人类试图运用失控转移器将里美输送到2002年来改变历史拯救人类。里美的任务只剩两天时间，只好请求宫本协助她拯救世界。宫本对里美的故事嗤之以鼻，他首先要解决的敌人是有着三合会背景的沟口，然而在里美的威逼之下，宫本只好扮演起救世主…
